어느 날 루파 아주머니는 세 명의 조카 제로니모, 테아, 트랩에게 편지를 보내 찍찍 신문사로 모이게 한 뒤 비밀스러운 모험을 제안한다. 보물을 찾아 항해를 떠났다가 실종된 루파 아주머니의 남편 털북숭 아저씨가 마지막으로 항해했던 바다에 함께 가 보자는 것이었다. 그런데 그곳은 루파 아주머니가 우연히 발견한 ‘배불뚝이 빅마우스 쥐타카 선장의 항해 일지’에 쓰여 있는 거대생쥐주둥이호가 침몰한 곳과 정확히 일치했다. 드디어 루파 아주머니와 스틸턴 가족들은 침몰한 거대생쥐주둥이호를 찾아 드넓은 바다를 항해하게 되는데……. 마침내 거대생쥐주둥이호를 발견하고 그 안에서 엄청난 보물을 찾게 되는 제로니모와 그의 가족들! 그 순간 보물을 노리는 수상한 생쥐들이 나타나 보물을 가로채려고 한다! 과연 제로니모와 그의 가족들은 바다 깊은 곳에 가라앉은 보물선에 숨겨진 귀한 보물을 무사히 지켜 낼 수 있을까? 그리고 털북숭 아저씨가 위험을 무릅쓰고 찾으려고 했던 그 보물은 도대체 무엇일까?