『일본 속의 고대 한국 문화』는 가야, 백제, 신라와 왜 왕조의 교섭으로 구분하여 상세하게 설명하고, 종래의 한반도-왜의 관계가 가야, 백제에 한정된 것이 아니고, 신라와의 관계 역시 중요하게 이루어 졌음을 밝힌다. 또한 한반도와 왜의 관계가 일본 학계에서 주장하는 ‘임나일본부’설에 따른 군사적 정복관계가 전혀 아닌, 평화적인 정치교섭과 상업적 무역이 중심이 된다는 학설을 제시한다. 저자가 제시하는 중요한 결론 가운데 하나는 일본이 받아들인 대륙의 문화는 직접 이입된 것이 아니라, 한반도에서 토착화되고 최적화된 상태에서 일본으로 이입되는 것이다. 책의 첫 5개 장에서는 이러한 저자의 한일 교섭사에 대한 이론적인 연구 성과가 제시된다.

I. 연구서의 검토와 본서의 과제
1. 연구사 검토
2. 본서의 과제

II. 일본 속의 가야문화
1. 일본 출토 가야문물
2. 일본 열도 속의 가야문화와 이입 배경

III. 일본 속의 신라문화
1. 일본 열도의 신라문물
2. 일본 열도 속의 신라 문화와 이입 배경

IV. 일본 속의 백제문화
1. 일본 열도의 백제문물
2. 일본 열도 속의 백제 문화와 이입 배경

V. 일본 속의 고대 한반도 문화의 이입 배경과 역사적 의의

VI. 일본속의 고대 한국 문화 관련 유적
1. 나가사키현
2. 사가현
3. 후쿠오카현
4. 오이타현
5. 구마모토현
6. 미야자키현
7. 가고시마현
8. 야마구치현
9. 에히메현
10. 가가와현
11. 히로시마현
12 오카야마현
13. 시마네현
14. 돗토리현
15. 효고현
16. 교토부
17. 오사카부
18. 나라현
19. 와카야마현
20. 미에현
21. 시가현
22. 후쿠이현
23. 이시카와현
24. 도야마현
25. 니이가타현
26. 기후현
27. 아이찌현
28. 시즈오카현
29. 나가노현
30. 야마나시현
31. 군마현
32. 사이타마현
33. 가나가와현
34. 도쿄토
35. 지바현
36. 이바라키현
37. 도치기현
38. 후쿠시마현
39. 미야기현
40. 아오모리현