경제·인문사회연구회의 소관 연구기관에 대한 평가의 목적은 연구기관이 설립목적에 부합하는 성과를 올리고 있는지를 판단하고, 그 기능 수행 과정이 효과적으로 관리되고 있는지를 검토하여, 정부출연연구기관의 연구수월성을 높이고 임무수행의 결과가 더 높은 단계로 갈 수 있도록 촉진하는 데 목적이 있다.